خاتمی با تاکید بر این که دولت نوپای عراق باید تقویت شود تا بتواند خود را اداره کند، گفت: « متاسفانه دست‌هایی وجود دارد که در صدد ایجاد آشوب و دامن زدن به اختلاف‌های قومی و مذهبی هستند و این، هم برای عراق و هم منطقه خطرناک است.» خاتمی با عنوان این که « زمزمه تجزیه عراق برای منطقه بسیار خطرناک است . همه ما باید تلاش کنیم که دولت مرکزی عراق تقویت شود و اشغال هرچه زودتر پایان یابد و با وجود یک دولت متحد قوی با حفظ تمامیت ارضی شاهد یک عراق باثبات و امن باشیم و ایران و ترکیه در این زمینه از دیدگاه‌های نزدیک به یکدیگر برخوردارند.» وی در پاسخ به این سوال که تشکیل یک دولت مستقل کرد در شمال عراق چه تاثیری در ایران و ترکیه خواهد داشت، گفت: « سوال من اینست که اگر تشکیل دولتهای قومی درست است، چرا اروپا خودش اقدام نمی‌کند و برای اقوامی که در اروپا هستند، دولت تشکیل نمی‌دهد. » امروز، دنیا، دنیای دولت ملت است. «هر گونه تجزیه‌ای، یک توطئه بین‌المللی است و من معتقدم که چنین تجزیه‌ای نه به نفع خود اکراد و نه به نفع کردهای منطقه خواهد بود و باید بشدت از آن پرهیز شود و عراق متحد مورد توجه قرار گیرد و کردهای عراقی نیز هم چنانکه اکنون نیز در دولت حضور دارند، در حدی که قانون اجازه می‌دهد در صحنه اجتماعی حضور داشته باشند و باید تلاش کنیم که عراق تجزیه نشود.» رییس سابق جمهوری اسلامی ایران اضافه کرد: « من فکر می‌کنم که تجزیه عراق خواست گروه‌های محدودی است که که مورد سوء‌استفاده قدرتهای خارجی قرار گرفته‌اند. هر گونه تجزیه‌ای در عراق چه مذهبی و چه قومی در درجه اول به زیان خود عراق است و عراق را نا آرام خواهد کرد و گروه‌های قومی و مذهبی دیگر آن را تحمل نخواهند کرد.» وی افزود: "معتقدم که اکثریت مردم منطقه از بروز نا امنی پرهیز می‌کنند و امیدوارم که اجازه نفوذ به گروه‌های آشوب طلب و آشوب آفرین ندهند تا دولتها بتوانند امنیت خودشان را بخصوص در مرزها تامین کنند." خاتمی با تاکید بر لزوم همکاری‌های گسترده کشورهای منطقه گفت: « معتقدم که باید متوجه سوء استفاده قدرتهای بیگانه از آشوبهایی که در منطقه ایجاد می‌شود و با منافع ملی ما مغایرت دارد، باشیم و جلو این آشوبها را بگیریم.» خاتمی افزود: کردهای منطقه اگر احساس کنند که بخشی از ملت هستند و بخصوص احساس تبعیض نکنند، این برای ناکام ماندن تروریستها و تجزیه طلبان بهترین روش است و در عین حال باید برای مقابله با تهاجمها هم آماده باشیم.