یک گروه دیده‌بان حقوق بشر، ایالات متحده آمریکا و سایر کشورها را متهم کرد که از اواسط دهه 90 تا کنون ده‌ها زندانی مسلمان را به مصر اعزام کرده‌اند که در آنجا احتمالاً مورد شکنجه قرارگرفته‌اند. این گروه دیده‌بان حقوق بشر با انتشار گزارشی 53 صفحه‌ای از مصر به عنوان مهمترین دریافت کننده زندانی از جمله مجاهدان مسلمان در جهان نام برد. در این گزارش به نام 61 زندانی که از سال 1994 به زندان‌های مصر فرستاده شده‌اند، اشاره شده است که تقریباً همگی مجاهدان مسلمان مصری هستند. همچنین در گزارش تخمین زده شده که از 11 سپتامبر تاکنون 150 تا 200 زندانی منتقل شده‌اند. اغلب زندانیان از کشورهای عربی و جنوب آسیا به مصر اعزام شده‌اند اما نام سوئد و آمریکا نیز در فهرست کشورهای اعزام کننده به چشم می خورد. این زندانیان در مصر احتمالاً تحت شکنجه قرار می‌گیرند. این گزارش به نقل از آمارهای سازمان حقوق بشر مصر عنوان می‌کند که بین سال‌های 1993 و 2004 حداقل 292 مورد شکنجه در این کشور روی داده است که در 120 مورد زندانی کشته شده است. شکنجه زندانیان به قدری در مصر شایع است که هر بار ایالات متحده یا هر کشور دیگری مظنونی را به این کشور اعزام می‌کنند، کنوانسیون بین‌المللی ضد شکنجه را نقض کرده‌اند. این در حالی است که جرج بوش، رییس جمهور آمریکا ادعا می‌کند: «ما در چارچوب قانون عمل می‌کنیم و زندانیان را به کشورهایی اعزام می‌کنیم که تحت شکنجه قرار نمی‌گیرند.» دیده‌بان حقوق بشر دولت بوش را متهم کرده که با آگاهی از احتمال شکنجه شدن زندانیان، آنها را به کشورهای دیگر می‌فرستند. به گزارش رسانه‌ها و مقامات، سیا 80 نفر را قبل از 11 سپتامبر 2001 و 150 نفر را پس از آن به خارج اعزام کرده است.